MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium novyi NT chromosome

Total Repeats: 69818

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008593	TAAA	2	8	24	31	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008593	TAA	2	6	96	101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008593	ATT	2	6	109	114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008593	TCA	2	6	121	126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008593	ATA	3	9	127	135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008593	A	6	6	171	176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008593	AAT	2	6	182	187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008593	CAA	2	6	199	204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008593	TA	4	8	236	243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008593	GAT	2	6	267	272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008593	TA	3	6	309	314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008593	A	7	7	314	320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008593	ACCA	2	8	348	355	50 %	0 %	0 %	50 %	118444385
14	NC_008593	A	6	6	355	360	100 %	0 %	0 %	0 %	118444385
15	NC_008593	A	7	7	370	376	100 %	0 %	0 %	0 %	118444385
16	NC_008593	GAA	2	6	414	419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444385
17	NC_008593	CAT	2	6	421	426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118444385
18	NC_008593	AGA	3	9	431	439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444385
19	NC_008593	GAA	2	6	447	452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444385
20	NC_008593	A	7	7	451	457	100 %	0 %	0 %	0 %	118444385
21	NC_008593	TGG	2	6	480	485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008593	A	8	8	505	512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008593	TA	3	6	521	526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008593	A	6	6	550	555	100 %	0 %	0 %	0 %	118443844
25	NC_008593	TA	3	6	573	578	50 %	50 %	0 %	0 %	118443844
26	NC_008593	AAT	3	9	632	640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443844
27	NC_008593	AGTAG	2	10	650	659	40 %	20 %	40 %	0 %	118443844
28	NC_008593	A	6	6	674	679	100 %	0 %	0 %	0 %	118443844
29	NC_008593	GATT	2	8	714	721	25 %	50 %	25 %	0 %	118443844
30	NC_008593	GTA	2	6	744	749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443844
31	NC_008593	TTG	2	6	777	782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118443844
32	NC_008593	AAAT	2	8	787	794	75 %	25 %	0 %	0 %	118443844
33	NC_008593	TTA	2	6	839	844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118443844
34	NC_008593	TA	3	6	858	863	50 %	50 %	0 %	0 %	118443844
35	NC_008593	ATA	2	6	877	882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443513
36	NC_008593	ATA	2	6	892	897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443513
37	NC_008593	AT	4	8	912	919	50 %	50 %	0 %	0 %	118443513
38	NC_008593	A	6	6	927	932	100 %	0 %	0 %	0 %	118443513
39	NC_008593	TTG	2	6	936	941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118443513
40	NC_008593	TAA	2	6	984	989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443513
41	NC_008593	GTA	2	6	1007	1012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443513
42	NC_008593	AGG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008593	T	7	7	1132	1138	0 %	100 %	0 %	0 %	118442981
44	NC_008593	CAAT	2	8	1139	1146	50 %	25 %	0 %	25 %	118442981
45	NC_008593	AAT	2	6	1153	1158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118442981
46	NC_008593	T	6	6	1171	1176	0 %	100 %	0 %	0 %	118442981
47	NC_008593	TAA	2	6	1241	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118442981
48	NC_008593	ATA	2	6	1255	1260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118442981
49	NC_008593	ATGA	2	8	1315	1322	50 %	25 %	25 %	0 %	118442981
50	NC_008593	A	6	6	1339	1344	100 %	0 %	0 %	0 %	118442981
51	NC_008593	ACAAA	2	10	1347	1356	80 %	0 %	0 %	20 %	118442981
52	NC_008593	ACA	3	9	1377	1385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118442981
53	NC_008593	ATG	2	6	1390	1395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118442981
54	NC_008593	TA	3	6	1400	1405	50 %	50 %	0 %	0 %	118442981
55	NC_008593	AGG	2	6	1428	1433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118442981
56	NC_008593	ACT	2	6	1443	1448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118442981
57	NC_008593	TAT	2	6	1477	1482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118442981
58	NC_008593	TAA	2	6	1488	1493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118442981
59	NC_008593	TTAT	2	8	1620	1627	25 %	75 %	0 %	0 %	118442981
60	NC_008593	AAT	2	6	1635	1640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118442981
61	NC_008593	ATG	2	6	1684	1689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118442981
62	NC_008593	AT	3	6	1716	1721	50 %	50 %	0 %	0 %	118442981
63	NC_008593	A	7	7	1818	1824	100 %	0 %	0 %	0 %	118442981
64	NC_008593	GAA	2	6	1825	1830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118442981
65	NC_008593	ACA	2	6	1845	1850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008593	AGA	2	6	1935	1940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444639
67	NC_008593	AGA	2	6	2004	2009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444639
68	NC_008593	TGAGGT	2	12	2052	2063	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	118444639
69	NC_008593	AGA	3	9	2154	2162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444639
70	NC_008593	GATT	2	8	2201	2208	25 %	50 %	25 %	0 %	118444639
71	NC_008593	TAGT	2	8	2249	2256	25 %	50 %	25 %	0 %	118444639
72	NC_008593	AAT	2	6	2275	2280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118444639
73	NC_008593	TAGAAG	2	12	2319	2330	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118444639
74	NC_008593	AGA	2	6	2331	2336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444639
75	NC_008593	A	7	7	2377	2383	100 %	0 %	0 %	0 %	118444639
76	NC_008593	GA	3	6	2422	2427	50 %	0 %	50 %	0 %	118444639
77	NC_008593	ATTC	2	8	2434	2441	25 %	50 %	0 %	25 %	118444639
78	NC_008593	GAA	2	6	2485	2490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444639
79	NC_008593	AGA	2	6	2497	2502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444639
80	NC_008593	A	6	6	2517	2522	100 %	0 %	0 %	0 %	118444639
81	NC_008593	CTTT	2	8	2540	2547	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_008593	TAA	2	6	2555	2560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008593	A	6	6	2559	2564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008593	GAA	2	6	2588	2593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008593	GCG	2	6	2615	2620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118444248
86	NC_008593	CAA	2	6	2625	2630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118444248
87	NC_008593	GAT	2	6	2729	2734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118444248
88	NC_008593	TAT	2	6	2764	2769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118444248
89	NC_008593	CAG	2	6	2838	2843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118444248
90	NC_008593	TGT	2	6	2848	2853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118444248
91	NC_008593	TGG	2	6	2869	2874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118444248
92	NC_008593	GTT	2	6	2876	2881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118444248
93	NC_008593	GAA	2	6	2970	2975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444248
94	NC_008593	TAA	2	6	3009	3014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118444248
95	NC_008593	ATT	2	6	3110	3115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118444248
96	NC_008593	AGA	2	6	3145	3150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444248
97	NC_008593	AGA	2	6	3157	3162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444248
98	NC_008593	TGA	2	6	3205	3210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118444248
99	NC_008593	TTA	2	6	3221	3226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118444248
100	NC_008593	AAC	2	6	3361	3366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118444248
101	NC_008593	ATA	2	6	3416	3421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118444248
102	NC_008593	TGA	2	6	3445	3450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118444248
103	NC_008593	TGT	2	6	3451	3456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118444248
104	NC_008593	A	6	6	3459	3464	100 %	0 %	0 %	0 %	118444248
105	NC_008593	AG	3	6	3482	3487	50 %	0 %	50 %	0 %	118444248
106	NC_008593	AAC	2	6	3494	3499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118444248
107	NC_008593	GAT	2	6	3542	3547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118444248
108	NC_008593	AT	3	6	3586	3591	50 %	50 %	0 %	0 %	118444248
109	NC_008593	TAT	2	6	3594	3599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118444248
110	NC_008593	AGAT	2	8	3624	3631	50 %	25 %	25 %	0 %	118444248
111	NC_008593	AAG	2	6	3633	3638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444248
112	NC_008593	AT	3	6	3661	3666	50 %	50 %	0 %	0 %	118444248
113	NC_008593	AAG	2	6	3711	3716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444248
114	NC_008593	ATT	2	6	3727	3732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118444248
115	NC_008593	AACA	2	8	3769	3776	75 %	0 %	0 %	25 %	118444248
116	NC_008593	AAG	2	6	3786	3791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444248
117	NC_008593	AAAG	2	8	3806	3813	75 %	0 %	25 %	0 %	118444248
118	NC_008593	ACA	2	6	3840	3845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118444248
119	NC_008593	GAA	2	6	3923	3928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444248
120	NC_008593	ATA	2	6	3932	3937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118444248
121	NC_008593	AGTA	2	8	4075	4082	50 %	25 %	25 %	0 %	118443722
122	NC_008593	TGT	2	6	4084	4089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118443722
123	NC_008593	ATG	2	6	4118	4123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443722
124	NC_008593	AGG	2	6	4141	4146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118443722
125	NC_008593	CA	3	6	4214	4219	50 %	0 %	0 %	50 %	118443722
126	NC_008593	TA	3	6	4220	4225	50 %	50 %	0 %	0 %	118443722
127	NC_008593	GA	3	6	4304	4309	50 %	0 %	50 %	0 %	118443722
128	NC_008593	AGA	2	6	4378	4383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443722
129	NC_008593	AAT	3	9	4474	4482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443722
130	NC_008593	AATA	2	8	4600	4607	75 %	25 %	0 %	0 %	118443722
131	NC_008593	GAA	2	6	4608	4613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443722
132	NC_008593	GAT	2	6	4630	4635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443722
133	NC_008593	TGA	2	6	4648	4653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443722
134	NC_008593	ATAG	2	8	4760	4767	50 %	25 %	25 %	0 %	118443722
135	NC_008593	CAC	2	6	4770	4775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118443722
136	NC_008593	CTT	2	6	4818	4823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118443722
137	NC_008593	AAGAT	2	10	4827	4836	60 %	20 %	20 %	0 %	118443722
138	NC_008593	AGA	2	6	4897	4902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443722
139	NC_008593	GGA	2	6	4913	4918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118443722
140	NC_008593	AAG	2	6	4960	4965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443722
141	NC_008593	ATG	2	6	4991	4996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443722
142	NC_008593	CTTT	2	8	5048	5055	0 %	75 %	0 %	25 %	118443722
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144	NC_008593	AATG	2	8	5095	5102	50 %	25 %	25 %	0 %	118443722
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154	NC_008593	AAG	2	6	5451	5456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443722
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159	NC_008593	AGATA	2	10	5752	5761	60 %	20 %	20 %	0 %	118443722
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213	NC_008593	AT	4	8	7609	7616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_008593	A	6	6	9144	9149	100 %	0 %	0 %	0 %	118443024
260	NC_008593	GAC	2	6	9153	9158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118443024
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265	NC_008593	AT	3	6	9301	9306	50 %	50 %	0 %	0 %	118443024
266	NC_008593	GGA	2	6	9349	9354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
267	NC_008593	AAT	2	6	9371	9376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443471
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272	NC_008593	AAG	2	6	9494	9499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443471
273	NC_008593	GAAT	2	8	9511	9518	50 %	25 %	25 %	0 %	118443471
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275	NC_008593	CTT	2	6	9544	9549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118443471
276	NC_008593	AGA	2	6	9575	9580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443471
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279	NC_008593	TTA	2	6	9708	9713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118443471
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500	NC_008593	A	6	6	16817	16822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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